研究表明石灰石可以作为深层生物圈微生物遗传信息的储存库
地球上的大部分微生物生物量都隐藏在地下。据估计,微生物可以在大陆表面以下五公里深处找到。它们也在这里定居在坚硬的岩石上。由于难以进入这个深层生物圈,研究人员对这些微生物的组成和在生物地球化学循环中的作用知之甚少。
来自耶拿弗里德里希席勒大学及其卓越微宇宙平衡集群以及其他研究网络和机构的一个研究小组现已发现,石灰岩可以作为地下微生物定殖的档案。该研究的第一个结果已发表在doi.org/10.1186/s40168-023-01647-2>Microbiome杂志上。
该研究的主要作者Carl-EricWegner博士表示:“我们检查了图林根盆地300米深处的钻芯,以深入了解固体岩石中的生物量以及岩石中微生物组的代谢状态。”。“根据之前的研究结果,我们假设石灰石中的高钙含量可以保存微生物的DNA,类似于木乃伊或骨骼中的牙结石。然而,由于岩石中的生物量较低,必须对现有方法进行调整。”
为了提取岩石样本中的DNA进行所谓的宏基因组分析,研究人员采用了微生物考古学和古基因组学的方法。“我们的目标是破译石头中微生物的遗传信息,并在分类学和功能上对它们进行分类,”耶拿大学微生物组科学教授ChristinaWarinner博士解释道。
“我们还能够在三个岩石样本中检测到过去微生物群落(即所谓的古组群)的遗传信息。这些信息为我们提供了有关当这些微生物还活着时哪些代谢性能发挥作用的信息,”柯尔斯滕教授说。库塞尔,微宇宙平衡卓越集群的发言人,也是该研究的发起人。
作者得出的结论是,对石灰石的研究特别合适,因为它的特性有利于遗传信息的长期保存。“确定内石DNA的年龄是地下地质微生物历史的关键,”Küsel说。
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