全基因组测序可改善罕见病的诊断并缩短患者的诊断旅程

发表在《新英格兰医学杂志》上的一项世界首创的科学研究表明，全基因组测序 (WGS) 可以为最广泛的罕见病患者发现新的诊断。迄今为止调查的疾病，可以为整个 NHS 带来巨大的好处。

对罕见未确诊疾病的初步研究涉及分析来自 2,183 个家庭的 4,660 人的基因——他们都是100,000 基因组计划的早期参与者。由 Genomics England 和 NHS England 领导的开创性项目于 2013 年成立，旨在对 NHS 患者及其家人的 100,000 个全基因组进行测序。

这项由英国基因组学和伦敦玛丽女王大学领导并与国家健康研究所 (NIHR) BioResource 合作开展的试点研究发现，使用WGS 可以为 25% 的参与者带来新的诊断。在这些新诊断中，有 14% 是在基因组区域中发现的，这些区域会被其他传统方法(包括其他类型的非全基因组测试)遗漏。

许多参与者经历了多年的约会，但没有得到任何答案。通过对他们的全基因组测序，发现了以前无法检测到的诊断。试点研究表明，WGS 可以有效地确保患者得到诊断，节省 NHS 重要资源并为其他干预措施铺平道路。

通过试点获得诊断的参与者包括：

一名 10 岁的女孩，此前 7 年寻求诊断，在 307 次医院就诊中多次入院重症监护，费用为 356,571 英镑。基因组诊断使她能够接受治疗性骨髓移植(费用为 70,000 英镑)。此外，对她的兄弟姐妹的预测测试表明，没有其他家庭成员处于危险之中。

一名 60 多岁的男子，因严重的肾脏疾病接受了多年的治疗，包括两次肾移植。已经知道他的女儿遗传了同样的疾病，通过查看他和他女儿的全基因组做出的基因组诊断使他 15 岁的孙女能够接受测试。这表明她没有遗传这种疾病，可以停止定期进行昂贵的检查。

一个婴儿出生后立即病重，不幸在四个月时死亡，但没有诊断和医疗费用 80,000 英镑。对他的全基因组的分析发现，由于无法在细胞内摄取维生素 B12，导致他患有严重的代谢紊乱，从而解释了他的病情。这使得他的弟弟在出生后一周内就可以进行预测性测试。年幼的孩子被诊断出患有同样的疾病，但能够通过每周注射维生素 B12 来治疗以防止疾病进展。

对于大约四分之一的研究参与者来说，他们的诊断意味着他们能够获得更有针对性的临床护理。这包括进一步的家庭筛查、饮食改变、提供维生素和/或矿物质以及其他疗法。

该研究首次分析了 WGS 对国家医疗保健系统内广泛罕见疾病的诊断和临床影响。研究结果支持其在全球卫生系统中的广泛采用。

WGS 在试点研究中观察到的特定病症(包括智力障碍、视力和听力障碍，诊断率为 40-55%)的高性能支持了将 WGS 纳入诊断特定罕见疾病作为新NHS的一部分的理由国家基因组测试目录。

该试点研究还与承担测序的国家卫生研究所 (NIHR) 和 Illumina 合作进行，并由 NIHR、威康信托基金、医学研究委员会、英国癌症研究中心、卫生部资助和社会关怀，以及 NHS 英格兰。